土壤微生物可以形成土壤结构。土壤并不是单纯的土壤颗粒和化肥的简单结合，作为土壤的活跃组成分, 土壤微生物在自己的生活过程中，通过代谢活动的氧气和二氧化碳的交换，以及分泌的有机酸等有助于土壤粒子形成大的团粒结构，最终形成真正意义上的土壤。土壤微生物的区系组成、生物量及其生命活动对土壤的形成和发育有密切关系。土壤微生物是指在土壤中生活着的种类繁多的微生物，如细菌、放线菌、真菌、土壤藻类和微小动物等。土壤微生物有些对农业有益，有些却是有害的，土壤微生物是土壤中一个非常重要的组成成分，它对土壤性质、土壤肥力的形成及作物生长都有很重要的作用。首先，在土壤的形成中，其实质是土壤有机质的合成和分解，而有机质的合成和分解都有微生物的参与。微生物是土壤有机质积累的先锋，同时，有机质的分解更离不开微生物的作用。由于微生物分解有机质释放养分的作用，就将地壳中有限的营养元素能周而复始的利用，保证整个植物生长发育对养分无限的要求。在培肥土壤过程中使用各种措施使土壤更适于植物生长的要求，而这些措施主要靠微生物来参加作用。所以通过农业措施来培肥土壤的过程，即农业土壤熟化的过程，很多方面也就是调节土壤微生物活动的过程，如耕作、施肥、灌水、排水等措施都适当地调节了微生物的生态环境，促进有益微生物朝着培肥地力的方向发展，提高土壤肥力;