首先通过资料收集和走访了解农田污染的来源、历史、面积等基本情况，确定采样的密度、方法;其次利用全球定位系统(GPS)仪器确定采样地块和土壤采样点的具体位置，采样竹片、木片或不锈钢的铁锹挖掘农田土壤，一般分为水平调查和垂直调查：水平调查一般采集0～20厘米的耕作层土壤，而垂直调查需要挖1～2米深的土壤剖面，从下往上进行分层取样;水平调查可采用对角线、蛇形和棋盘取样法，将每块地至少取5个样点的土样充分混合、分减成1千克左右的土壤装入棉布做的土壤袋或塑料封口袋;最后做好样品编号和档案纪录，如土样编号、采样地点及经纬度、土壤名称、采样深度、前茬作物及产量、采样日期、采样人等。